Auch: Mikrobiota. Bezeichnet im weitesten Sinn die Gesamtheit aller Mikroorganismen der Erde und im engeren Sinn die Gesamtheit aller den Menschen oder andere Lebewesen besiedelnden Mikroorganismen. Beim Mikrobiom des Darms (auch: Darmflora) spricht man daher von allen Mikroorganismen, die im menschlichen Darm leben. Der menschliche Verdauungstrakt enthält ca. 100 Billionen Mikroorganismen, das sind zehnmal mehr Bakterien als der menschliche Körper Zellen hat. Das Darmmikrobiom wird von vielen Faktoren beeinflusst: Geburtsvorgang, Wohnort, Lebensstil wie Ernährung und Bewegung, Medikamenteneinnahme uvm. Die Mikroorganismen übernehmen wichtige Aufgaben, können aber auch Krankheiten auslösen. Sie stärken zum Beispiel das Immunsystem und verhindern die Ausbreitung von krankmachender Bakterien und Pilzen. Andere Mikroorganismen können wiederum für bestimmte Infektionen, wie Durchfallerkrankungen oder Darmentzündungen verantwortlich sein sowie Übergewicht oder Diabetes Mellitus fördern.